Dupliquez le calque.

Ajoutez un masque de fusion à ce calque.
Coloriez l'oeil (pas la pupille) avec la couleur noir, au pinceau.
Rien n'apparait ce qui est normal.

Ensuite allez sur le calque du bas.
Faites image => reglage => teinte/saturation
Cochez la case "Redéfinir".

C'est terminé !

Vous pouvez effectuer tous les essais souhaités et changer la couleur des yeux à votre guise.